Предназначен для содержания подозреваемых и обвиняемых (подсудимых и осуждённых) в совершении преступлений, в отношении которых в качестве меры пресечения применено заключение под стражу, а также для исполнения уголовного наказания в виде лишения свободы в отношении осуждённых, оставленных для выполнения работ по хозяйственному обслуживанию, а также в отношении осуждённых на срок не свыше шести месяцев, оставленных в следственных изоляторах с их письменного согласия
Со времен ГУЛАГа на месте, где располагается сегодня следственный изолятор, находились лагерные постройки. Тогда, в 40-х, здесь был всего один режимный корпус.
22 апреля 1959 года на базе ДПЗ (Дома предварительного заключения) Воркутинского горотдела милиции образована Следственная тюрьма № 3.
31 октября 1963 года решением Коллегии Министерства охраны общественного порядка РСФСР был образован новый вид учреждения – следственный изолятор, и установлен порядок изолированного содержания лиц, осужденных к тюремному заключению. Соответственно следственная тюрьма № 3 в этом же году была преобразована в следственный изолятор № 3.
